Ravindra Garde-Postdoktorand
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Erfahrungen
Postdoktorand
Helmholtz-Institut für Infektionsforschung
- Entwicklung eines agentenbasierten Modells zur Erklärung der Diskrepanz zwischen Dosierung und Aufnahme von Antibiotika in Bakterien
- Förderung der Zusammenarbeit mit Mikrobiologen zur Entwicklung eines datengesteuerten Rahmens für Antibiotikadosierung
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Institut für Arzneimittelforschung, Universität Leipzig
- Bewilligung des DFG Walter-Benjamin-Stipendiums, was Initiative und Engagement für die eigene Weiterentwicklung bei gleichzeitigem Beitrag zu bedeutenden Forschungsprojekten zeigt
- Entwicklung einer Pipeline für Metadynamik-Simulationen mit kollektiven Variablen zur Beschreibung des Öffnungsvorgangs eines Anionenkanals
- Docking eines potenziellen Therapeutikums an das Untersuchungsprotein
- Beherrschung von vHTS und Enhanced-Sampling-MD-Simulationen mit PLUMED innerhalb von 3 Monaten, wodurch Workflows für Projekte in der Proteininformatik optimiert wurden
- Teilnahme an kooperativen Nebenprojekten zur Modellierung der Struktur von TLR4, gebunden an ein Protein, mit AlphaFold2 Multimer
- Beitrag zu RosettaCon durch Teilen von Erkenntnissen zu rechnergestützten Frameworks, Stärkung professioneller Netzwerke und Förderung innovativer Lösungen in der Strukturbiologie
Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Matthias-Schleiden-Institut für Genetik, Friedrich-Schiller-Universität
- Transkriptomanalyse von Sorghum bicolor, infiziert mit zwei Formae speciales von Sporisorium reilianum
- Erfolgreiche Wiederaufnahme und Abschluss eines lange stockenden Projekts
- Unterstützung einer Doktorandin/eines Doktoranden bei der Analyse von Mais-Transkriptomdaten
Doktorand
Max-Planck-Institut für chemische Ökologie, Friedrich-Schiller-Universität
- Erfolgreiche Anwendung eines Minimalmodells zur Beschreibung von Biofilm-Wachstumsoszillationen und Weiterentwicklung des Modells
- Aufbau von Kooperationen innerhalb der Forschungsgruppe und Mitwirkung an einem umfassenden Übersichtsartikel zur Modellierung von Wirt-Pathogen-Interaktionen
- Kritische Bewertung von Projekten, Daten und Leistung, was in der Veröffentlichung in internationalen, peer-reviewten Open-Access-Fachzeitschriften resultierte
- Vermittlung von Wissenschaft durch mündliche Vorträge und Posterpräsentationen auf Konferenzen
- Leitung und Betreuung eines praktischen Kurses zu Stoffwechsel- und Regulationsnetzwerken für Masterstudierende in jedem Sommersemester zwischen 2018 und 2020
- Betreuung der Bewerberinnen und Bewerber für die IMPRS-Promotionsprogramme in den Jahren 2017 und 2018
Branchenerfahrung
Sieh, in welchen Branchen dieser Freelancer den Großteil seiner beruflichen Laufbahn verbracht hat.
Erfahren in Biotechnologie, Bildung, Gesundheitswesen und Pharmazeutika.
Erfahrung nach Fachbereich
Zeigt, in welchen Abteilungen und Funktionen dieser Freelancer am meisten mitgewirkt hat.
Erfahren in Forschung und Entwicklung (F&E).
Fähigkeiten
- Hochqualifizierter Computational-biologe Mit Fortgeschrittenen Kenntnissen In Molekulardynamischen Simulationen, Ngs-datenanalyse, Systembiologie Und Virtuellem Hochdurchsatz-screening
- Umfangreiche Erfahrung Und Leidenschaft Für Strukturbasierte Modellierung Von Makromolekülen
- Leidenschaft Für Klinische Anwendungen Computergestützter Methoden
- Erfahren In Zielorientierter Projektentwicklung Im Team Oder Eigenständig
- Flexibler Und Anpassungsfähiger Profi, Der In Multikultureller Umgebung Aufblüht
- Enthusiastisch In Der Vermittlung Von Wissenschaft An Unterschiedliche Zielgruppen (Z. B. Kunden & Wissenschaftler) Mündlich Und Schriftlich
- Md-simulationen: Metadynamik, Gezielte Md, All-atom-md, Qm/mm
- Molekulare Modellierung: Alphafold, Rosetta, Amber, Gromacs, Plumed, Discovery Studio, Pymol, Schrödinger Suite
- Programmierung: Perl, Python, R, Bash
- Ngs: Transkriptomanalyse, Tuxedo, Galaxy
- Andere Tools: Confluence, Git, Jupyter Notebooks, Conda, Copasi, Celldesigner, Stella, Ms Office
- Wetlab: Spektrophotometrie, Grundlegende Mikrobiologische Und Molekularbiologische Techniken, Grundlegende Proteinaufbereitung
Sprachen
Ausbildung
Max-Planck-Institut für chemische Ökologie, Friedrich-Schiller-Universität Jena
Promotion · Jena, Deutschland
Bioinformatik-Zentrum, Universität Pune
Master of Science, Bioinformatik · Bioinformatik · Pune, Indien
Abasaheb Garware College, Universität Pune
Bachelor of Science, Biotechnologie · Biotechnologie · Pune, Indien
Zertifikate & Bescheinigungen
Data-Scientist-Bootcamp
Sorbonne-Universität
Nationale Bioinformatik-Zertifizierung (BINC)
Statistiken
Erfahrung
Globale Erfahrung
Fachkenntnisse
Qualifikationen
Profil
Häufig gestellte Fragen
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